Maatalouden ympäristönsuojelua toteutetaan lainsäädännön ja taloudellisten ohjauskeinojen avulla (tuki-järjestelmät) sekä ympäristötietoisuutta lisäämällä.
Keskeisimpiä maatalouden ympäristönsuojeluun liittyviä säädöksiä ovat ympäristönsuojelulaki (YSL 527/2014) ja -asetus (YSA 713/2014) sekä nitraattiasetus (1250/2014). Eläinsuojien lupa- ja valvontaviranomaisina toimivat ympäristönsuojelulain mukaan valtion lupa- ja valvontaviranomaiset (Aluehallintovirasto / ELY-keskus) sekä kuntien ympäristönsuojeluviranomaiset. Eläinsuojien lupaviranomaisen toimivalta määräytyy eläinsuojan koon perusteella. Nitraattiasetuksen valvontaviranomaisina toimivat kunnan maaseutuelinkeinoviranomaisen sekä kunnan ympäristönsuojeluviranomaisen. Nitraattidirektiivin edellyttämien raporttien laatimiseksi tarpeelliset tiedot sekä tiedot asetuksen rikkomisesta raportoidaan alueelliselle ELY-keskukselle.
Kunnan ympäristönsuojelu viranomaiselle toimitettavat eläinsuojien ympäristölupahakemuslomakkeet sekä lannan aumauksesta tai lannan levityksestä poikkeustilanteessa tehtävät ilmoitukset löytyvät Ympäristönsuojelun lomakkeista.
Nitraattiasetusta käsittelevä opas, Nitraattiasetuksen tulkinta on tarkoitettu toiminnanharjoittajille sekä viranomaisille.
